Akateemiset kumppanuudet luovat perustan sille tietotaidolle ja asiantuntemukselle, joita IHA pystyy tarjoamaan yrityskumppaneiden hyödyksi. Osan yritysten kanssa tehtävästä yhteistyöstä IHA toteutaa tutkimuskeskittymien kautta.
Merkittävä osa yksikön rahoitusta tulee projekteista yhdessä teollisuuden kanssa. IHA on hyvin aktiivinen strategisten huippuosaamisten keskittymissä (SHOK). IHA osallistuu kahteen tutkimusohjelmaan kahdessa eri SHOK:issa. Nämä ovat CLEEN Oy (energia- ja ympäristöalan strategisen huippuosaamisen keskittymä), ja FIMECC Oy (metallituotteet ja koneenrakennus -alan strategisen huippuosaamisen keskittymä). Tutkimusohjelma FIMECC Oy:ssa IHA osallistuu EFFIMA (energia- ja elinkaaritehokkaat koneet) tutkimusohjelmaan ja CLEEN Oy:ssa aktiivinen tutkimusohjelma IHA:n kannalta on FCEP (tulevaisuuden polttomoottorivoimalaitokset).