Tieteellinen laskenta on saanut huomattavan resurssin solukalvoreseptorien tutkimustyöhön
Tieteellinen laskenta TTY:ssä on saanut huomattavan resurssin tutkimustyötään varten. EU-rahoitteinen PRACE on myöntänyt prof. Ilpo Vattulaisen tutkimusryhmälle noin 60 miljoonan core-tunnin laskennallisen resurssin tutkimusprojektiin, jossa pyritään ymmärtämään EGFR-reseptorien toimintaa.Tieteellinen laskenta Tampereen teknillisessä yliopistossa on saanut huomattavan laskennallisen resurssin tutkimustyötään varten. EU-rahoitteinen PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe, www.prace-ri.eu) on myöntänyt prof. Ilpo Vattulaisen tutkimusryhmälle noin 60 miljoonan core-tunnin laskennallisen resurssin tutkimusprojektiin, jossa keskitytään solukalvoissa työtään tekevien EGFR-reseptorien toiminnan ymmärtämiseen. Häiriöt näiden reseptorien toiminnassa ovat yhteydessä vakaviin terveysongelmiin kuten rinta- ja keuhkosyövän kehittymiseen. PRACE-organisaation myöntämällä tuella Vattulaisen vetämä biologisen fysiikan tutkimusryhmä keskittyy selvittämään kuinka reseptorien toimintaa voidaan ohjata ja siten löytää uusia potentiaalisia lähestymiskeinoja tähän aihepiiriin liittyvien sairauksien hoitamiseen.
Tutkimus tulee keskittymään atomitason tietokonesimulaatioihin, mutta se integroidaan kokeelliseen tutkimukseen yhteistyöllä, jossa partnereina ovat muun muassa Dr. Unal Coskunin ja prof. Kai Simonsin vetämät tutkimusryhmät (Paul Langerhans Institute Dresden, Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (Dresden)).
Myönnetty resurssi on huomattava. Se vastaa noin 50% osuutta Suomen suurimman supertietokoneen vuotuisesta laskentaresurssista. Vaihtoehtoisesti voi ajatella, että jos kaikki TTY:llä olevat noin 4600 pöytätietokonetta annettaisiin tälle projektille, se ottaisi ne täysin omaan käyttöönsä ympärivuorokautisesti noin 1.5 vuoden ajaksi. Taloudellisesti projektin arvo on myös huomattava, sillä jos tälle resurssille lasketaan niin kutsuttu no-profit -arvo, mikä vastaa supertietokonekeskuksen kulua tämän laskentaresurssin tuottamisesta (ilman katetta), on se karkeasti noin 5 miljoonaa euroa.
Myönnetty laskentaresurssi täytyy käyttää Cray XE6-supertietokoneella "Hermit" (Stuttgart, Saksa) yhden vuoden aikana tästä eteenpäin.
Lisätietoja: Prof. Ilpo Vattulainen, Fysiikan laitos (TTY). E-mail: Ilpo.Vattulainen@tut.fi.